El INCUAPA posee como uno de los objetivos de su plan de acción el de procesar, sistematizar, conservar y regular el acceso a las colecciones que tiene bajo estudio. Para ello, el laboratorio de arqueología del INCUAPA ha creado un área de conservación y preservación de bienes culturales (colecciones arqueológicas, paleontológicas y zoológicas) cuyo cometido es el adecuado mantenimiento, inventario, conservación e incremento de las colecciones para permitir el desarrollo de las investigaciones y la preservación del patrimonio que ellas representan.
El laboratorio cuenta con personal especializado (curador y conservador) y está equipado con campana extractiva de químicos, pileta para procesamiento de los materiales y capacidad para 8 personas trabajando simultáneamente. Equipos de computación y lupa binocular. Asimismo posee un espacio destinado a la preparación de colecciones y una oficina para el curador y el conservador.